Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VLDLRP98155 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VLDLRP98155 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms