Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRX3P78415 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRX3P78415 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRX3P78415 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRX3P78415 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRX3P78415 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRX3P78415 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRX3P78415 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRX3P78415 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRX3P78415 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRX3P78415 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRX3P78415 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRX3P78415 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRX3P78415 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRX3P78415 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRX3P78415 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRX3P78415 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRX3P78415 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRX3P78415 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRX3P78415 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRX3P78415 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRX3P78415 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRX3P78415 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRX3P78415 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRX3P78415 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRX3P78415 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRX3P78415 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRX3P78415 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
IRX3P78415 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRX3P78415 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRX3P78415 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
IRX3P78415 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRX3P78415 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRX3P78415 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRX3P78415 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRX3P78415 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRX3P78415 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRX3P78415 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRX3P78415 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRX3P78415 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRX3P78415 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRX3P78415 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRX3P78415 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRX3P78415 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRX3P78415 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRX3P78415 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRX3P78415 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRX3P78415 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
IRX3P78415 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
IRX3P78415 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
IRX3P78415 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
IRX3P78415 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IRX3P78415 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
IRX3P78415 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IRX3P78415 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
IRX3P78415 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IRX3P78415 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IRX3P78415 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IRX3P78415 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX3P78415 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX3P78415 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX3P78415 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX3P78415 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX3P78415 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX3P78415 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX3P78415 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX3P78415 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX3P78415 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX3P78415 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX3P78415 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX3P78415 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX3P78415 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX3P78415 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX3P78415 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX3P78415 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX3P78415 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX3P78415 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX3P78415 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX3P78415 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX3P78415 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX3P78415 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX3P78415 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX3P78415 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX3P78415 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX3P78415 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX3P78415 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX3P78415 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX3P78415 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX3P78415 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX3P78415 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX3P78415 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX3P78415 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX3P78415 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX3P78415 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX3P78415 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX3P78415 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX3P78415 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX3P78415 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX3P78415 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX3P78415 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms