Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNA1P78396 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms