Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRAMEP78395 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEP78395 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms