Protein–RNA interactions for Protein: P62899

RPL31, 60S ribosomal protein L31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL31P62899 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL31P62899 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL31P62899 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL31P62899 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL31P62899 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL31P62899 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL31P62899 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL31P62899 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL31P62899 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL31P62899 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL31P62899 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL31P62899 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL31P62899 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL31P62899 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL31P62899 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL31P62899 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL31P62899 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL31P62899 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL31P62899 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL31P62899 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL31P62899 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL31P62899 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL31P62899 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL31P62899 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL31P62899 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL31P62899 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL31P62899 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL31P62899 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL31P62899 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL31P62899 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL31P62899 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL31P62899 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL31P62899 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL31P62899 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL31P62899 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL31P62899 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL31P62899 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL31P62899 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL31P62899 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL31P62899 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL31P62899 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL31P62899 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL31P62899 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL31P62899 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL31P62899 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL31P62899 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL31P62899 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL31P62899 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL31P62899 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL31P62899 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL31P62899 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL31P62899 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL31P62899 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL31P62899 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL31P62899 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL31P62899 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL31P62899 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL31P62899 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL31P62899 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL31P62899 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL31P62899 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL31P62899 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL31P62899 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL31P62899 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL31P62899 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL31P62899 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL31P62899 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL31P62899 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL31P62899 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL31P62899 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL31P62899 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL31P62899 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL31P62899 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL31P62899 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL31P62899 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL31P62899 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL31P62899 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL31P62899 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL31P62899 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL31P62899 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL31P62899 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL31P62899 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL31P62899 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL31P62899 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL31P62899 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL31P62899 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL31P62899 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL31P62899 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL31P62899 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL31P62899 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL31P62899 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL31P62899 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL31P62899 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL31P62899 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL31P62899 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL31P62899 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL31P62899 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL31P62899 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL31P62899 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL31P62899 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms