Protein–RNA interactions for Protein: P62249

RPS16, 40S ribosomal protein S16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS16P62249 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPS16P62249 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPS16P62249 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPS16P62249 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPS16P62249 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPS16P62249 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPS16P62249 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPS16P62249 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPS16P62249 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPS16P62249 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS16P62249 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS16P62249 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS16P62249 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS16P62249 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS16P62249 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS16P62249 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS16P62249 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS16P62249 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS16P62249 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS16P62249 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS16P62249 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS16P62249 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS16P62249 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS16P62249 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS16P62249 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS16P62249 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS16P62249 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS16P62249 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS16P62249 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS16P62249 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS16P62249 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS16P62249 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS16P62249 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS16P62249 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS16P62249 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS16P62249 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS16P62249 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS16P62249 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS16P62249 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS16P62249 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS16P62249 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS16P62249 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS16P62249 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS16P62249 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS16P62249 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS16P62249 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS16P62249 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS16P62249 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS16P62249 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS16P62249 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS16P62249 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS16P62249 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS16P62249 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS16P62249 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS16P62249 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS16P62249 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS16P62249 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS16P62249 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS16P62249 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS16P62249 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS16P62249 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS16P62249 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS16P62249 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS16P62249 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS16P62249 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS16P62249 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS16P62249 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS16P62249 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS16P62249 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS16P62249 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS16P62249 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS16P62249 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS16P62249 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS16P62249 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS16P62249 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS16P62249 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS16P62249 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS16P62249 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS16P62249 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS16P62249 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS16P62249 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS16P62249 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS16P62249 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS16P62249 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS16P62249 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS16P62249 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS16P62249 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS16P62249 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS16P62249 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS16P62249 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RPS16P62249 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RPS16P62249 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS16P62249 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS16P62249 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS16P62249 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS16P62249 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS16P62249 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS16P62249 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS16P62249 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS16P62249 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms