Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAP25P60880 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAP25P60880 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms