Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA9P57773 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA9P57773 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA9P57773 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA9P57773 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA9P57773 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA9P57773 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA9P57773 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA9P57773 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA9P57773 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA9P57773 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA9P57773 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA9P57773 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA9P57773 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA9P57773 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA9P57773 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA9P57773 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA9P57773 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA9P57773 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA9P57773 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA9P57773 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA9P57773 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA9P57773 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA9P57773 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA9P57773 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA9P57773 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA9P57773 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA9P57773 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA9P57773 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA9P57773 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA9P57773 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA9P57773 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA9P57773 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA9P57773 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA9P57773 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA9P57773 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA9P57773 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA9P57773 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA9P57773 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA9P57773 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA9P57773 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA9P57773 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA9P57773 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA9P57773 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA9P57773 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA9P57773 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA9P57773 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA9P57773 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA9P57773 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJA9P57773 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GJA9P57773 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GJA9P57773 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GJA9P57773 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GJA9P57773 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GJA9P57773 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GJA9P57773 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJA9P57773 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJA9P57773 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA9P57773 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA9P57773 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA9P57773 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA9P57773 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA9P57773 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA9P57773 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA9P57773 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA9P57773 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA9P57773 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA9P57773 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA9P57773 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA9P57773 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA9P57773 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA9P57773 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA9P57773 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA9P57773 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA9P57773 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA9P57773 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA9P57773 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA9P57773 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA9P57773 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA9P57773 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA9P57773 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA9P57773 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA9P57773 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA9P57773 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA9P57773 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA9P57773 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA9P57773 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA9P57773 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA9P57773 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA9P57773 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA9P57773 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA9P57773 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA9P57773 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA9P57773 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA9P57773 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA9P57773 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA9P57773 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GJA9P57773 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA9P57773 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA9P57773 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms