Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX10P56693 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX10P56693 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX10P56693 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX10P56693 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOX10P56693 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SOX10P56693 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOX10P56693 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOX10P56693 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOX10P56693 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SOX10P56693 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOX10P56693 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOX10P56693 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOX10P56693 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX10P56693 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX10P56693 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX10P56693 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX10P56693 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX10P56693 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX10P56693 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX10P56693 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX10P56693 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX10P56693 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX10P56693 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX10P56693 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX10P56693 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX10P56693 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX10P56693 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX10P56693 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX10P56693 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX10P56693 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX10P56693 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX10P56693 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX10P56693 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX10P56693 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX10P56693 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX10P56693 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX10P56693 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX10P56693 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX10P56693 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX10P56693 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX10P56693 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX10P56693 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX10P56693 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX10P56693 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX10P56693 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX10P56693 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX10P56693 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX10P56693 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX10P56693 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX10P56693 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOX10P56693 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOX10P56693 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOX10P56693 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SOX10P56693 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOX10P56693 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOX10P56693 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX10P56693 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX10P56693 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX10P56693 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX10P56693 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX10P56693 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX10P56693 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX10P56693 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX10P56693 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX10P56693 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX10P56693 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX10P56693 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX10P56693 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX10P56693 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX10P56693 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX10P56693 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX10P56693 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX10P56693 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX10P56693 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX10P56693 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX10P56693 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX10P56693 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX10P56693 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX10P56693 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX10P56693 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX10P56693 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX10P56693 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX10P56693 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX10P56693 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX10P56693 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX10P56693 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX10P56693 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX10P56693 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX10P56693 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX10P56693 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX10P56693 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX10P56693 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX10P56693 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX10P56693 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX10P56693 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX10P56693 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX10P56693 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX10P56693 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX10P56693 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms