Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELLP55199 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELLP55199 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELLP55199 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELLP55199 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELLP55199 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ELLP55199 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELLP55199 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELLP55199 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELLP55199 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELLP55199 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELLP55199 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELLP55199 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELLP55199 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELLP55199 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELLP55199 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELLP55199 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELLP55199 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELLP55199 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELLP55199 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELLP55199 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELLP55199 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELLP55199 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELLP55199 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELLP55199 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELLP55199 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELLP55199 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELLP55199 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELLP55199 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELLP55199 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELLP55199 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ELLP55199 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ELLP55199 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELLP55199 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELLP55199 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELLP55199 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELLP55199 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELLP55199 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELLP55199 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELLP55199 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELLP55199 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELLP55199 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELLP55199 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELLP55199 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELLP55199 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELLP55199 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELLP55199 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELLP55199 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELLP55199 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELLP55199 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ELLP55199 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELLP55199 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELLP55199 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ELLP55199 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ELLP55199 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELLP55199 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELLP55199 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ELLP55199 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ELLP55199 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ELLP55199 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELLP55199 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ELLP55199 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELLP55199 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELLP55199 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELLP55199 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELLP55199 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELLP55199 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELLP55199 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELLP55199 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELLP55199 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELLP55199 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELLP55199 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELLP55199 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELLP55199 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELLP55199 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELLP55199 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELLP55199 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELLP55199 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELLP55199 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELLP55199 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELLP55199 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELLP55199 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELLP55199 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELLP55199 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELLP55199 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELLP55199 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELLP55199 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELLP55199 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELLP55199 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ELLP55199 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELLP55199 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELLP55199 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELLP55199 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELLP55199 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELLP55199 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELLP55199 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELLP55199 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELLP55199 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELLP55199 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELLP55199 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms