Protein–RNA interactions for Protein: P54578

USP14, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP14P54578 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP14P54578 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP14P54578 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP14P54578 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP14P54578 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP14P54578 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP14P54578 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP14P54578 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP14P54578 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP14P54578 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP14P54578 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP14P54578 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP14P54578 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP14P54578 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP14P54578 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP14P54578 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP14P54578 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP14P54578 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP14P54578 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP14P54578 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP14P54578 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
USP14P54578 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP14P54578 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP14P54578 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP14P54578 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
USP14P54578 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP14P54578 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP14P54578 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP14P54578 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP14P54578 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP14P54578 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP14P54578 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP14P54578 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP14P54578 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP14P54578 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP14P54578 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP14P54578 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP14P54578 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP14P54578 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP14P54578 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP14P54578 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP14P54578 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP14P54578 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP14P54578 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP14P54578 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP14P54578 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP14P54578 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP14P54578 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP14P54578 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP14P54578 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP14P54578 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP14P54578 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP14P54578 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP14P54578 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP14P54578 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP14P54578 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP14P54578 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP14P54578 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP14P54578 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP14P54578 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP14P54578 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP14P54578 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP14P54578 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP14P54578 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP14P54578 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP14P54578 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP14P54578 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP14P54578 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
USP14P54578 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP14P54578 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP14P54578 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP14P54578 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP14P54578 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP14P54578 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP14P54578 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
USP14P54578 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP14P54578 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP14P54578 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
USP14P54578 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP14P54578 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP14P54578 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP14P54578 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP14P54578 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP14P54578 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP14P54578 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
USP14P54578 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP14P54578 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP14P54578 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP14P54578 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP14P54578 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
USP14P54578 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP14P54578 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP14P54578 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP14P54578 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP14P54578 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP14P54578 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP14P54578 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP14P54578 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP14P54578 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP14P54578 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms