Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA8P53708 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA8P53708 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA8P53708 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms