Protein–RNA interactions for Protein: P51677

CCR3, C-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR3P51677 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR3P51677 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR3P51677 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR3P51677 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR3P51677 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR3P51677 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR3P51677 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR3P51677 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR3P51677 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR3P51677 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR3P51677 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR3P51677 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR3P51677 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR3P51677 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR3P51677 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR3P51677 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR3P51677 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR3P51677 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR3P51677 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR3P51677 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR3P51677 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR3P51677 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR3P51677 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR3P51677 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR3P51677 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR3P51677 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR3P51677 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR3P51677 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR3P51677 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR3P51677 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR3P51677 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR3P51677 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR3P51677 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR3P51677 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR3P51677 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR3P51677 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR3P51677 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR3P51677 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR3P51677 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR3P51677 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR3P51677 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR3P51677 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR3P51677 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR3P51677 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR3P51677 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR3P51677 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR3P51677 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR3P51677 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR3P51677 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR3P51677 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR3P51677 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR3P51677 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR3P51677 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR3P51677 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR3P51677 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR3P51677 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR3P51677 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR3P51677 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR3P51677 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR3P51677 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR3P51677 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR3P51677 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR3P51677 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR3P51677 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR3P51677 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR3P51677 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR3P51677 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR3P51677 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR3P51677 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR3P51677 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR3P51677 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR3P51677 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR3P51677 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR3P51677 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR3P51677 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR3P51677 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR3P51677 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR3P51677 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR3P51677 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR3P51677 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR3P51677 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR3P51677 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR3P51677 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR3P51677 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR3P51677 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR3P51677 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR3P51677 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR3P51677 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR3P51677 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR3P51677 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR3P51677 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR3P51677 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR3P51677 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR3P51677 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR3P51677 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR3P51677 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR3P51677 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR3P51677 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR3P51677 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR3P51677 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms