Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DAP3P51398 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DAP3P51398 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DAP3P51398 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DAP3P51398 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
DAP3P51398 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DAP3P51398 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DAP3P51398 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DAP3P51398 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DAP3P51398 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DAP3P51398 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DAP3P51398 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DAP3P51398 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DAP3P51398 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DAP3P51398 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DAP3P51398 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DAP3P51398 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DAP3P51398 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DAP3P51398 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DAP3P51398 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DAP3P51398 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DAP3P51398 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DAP3P51398 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DAP3P51398 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DAP3P51398 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DAP3P51398 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
DAP3P51398 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DAP3P51398 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DAP3P51398 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DAP3P51398 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DAP3P51398 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DAP3P51398 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DAP3P51398 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DAP3P51398 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DAP3P51398 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DAP3P51398 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DAP3P51398 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DAP3P51398 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DAP3P51398 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DAP3P51398 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DAP3P51398 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DAP3P51398 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DAP3P51398 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DAP3P51398 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DAP3P51398 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DAP3P51398 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DAP3P51398 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DAP3P51398 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DAP3P51398 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DAP3P51398 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DAP3P51398 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DAP3P51398 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DAP3P51398 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DAP3P51398 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DAP3P51398 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DAP3P51398 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DAP3P51398 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DAP3P51398 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DAP3P51398 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DAP3P51398 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DAP3P51398 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DAP3P51398 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DAP3P51398 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
DAP3P51398 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DAP3P51398 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DAP3P51398 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DAP3P51398 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DAP3P51398 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DAP3P51398 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DAP3P51398 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms