Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8P50990 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8P50990 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8P50990 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8P50990 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8P50990 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8P50990 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8P50990 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8P50990 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT8P50990 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT8P50990 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT8P50990 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT8P50990 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT8P50990 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT8P50990 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT8P50990 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8P50990 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8P50990 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8P50990 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8P50990 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8P50990 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8P50990 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8P50990 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8P50990 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8P50990 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8P50990 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCT8P50990 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCT8P50990 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCT8P50990 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCT8P50990 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCT8P50990 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCT8P50990 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCT8P50990 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCT8P50990 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCT8P50990 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCT8P50990 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCT8P50990 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT8P50990 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT8P50990 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT8P50990 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT8P50990 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT8P50990 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT8P50990 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT8P50990 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT8P50990 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT8P50990 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT8P50990 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT8P50990 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT8P50990 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT8P50990 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT8P50990 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT8P50990 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT8P50990 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT8P50990 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT8P50990 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT8P50990 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT8P50990 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT8P50990 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT8P50990 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT8P50990 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8P50990 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8P50990 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8P50990 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8P50990 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8P50990 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8P50990 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8P50990 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8P50990 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8P50990 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8P50990 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT8P50990 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT8P50990 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT8P50990 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT8P50990 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT8P50990 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT8P50990 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT8P50990 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT8P50990 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT8P50990 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT8P50990 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT8P50990 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT8P50990 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT8P50990 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT8P50990 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT8P50990 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT8P50990 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT8P50990 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT8P50990 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT8P50990 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8P50990 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8P50990 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8P50990 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8P50990 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8P50990 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8P50990 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8P50990 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8P50990 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8P50990 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8P50990 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8P50990 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms