Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CRIP1P50238 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms