Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NUP153P49790 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NUP153P49790 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NUP153P49790 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NUP153P49790 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NUP153P49790 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NUP153P49790 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NUP153P49790 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NUP153P49790 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NUP153P49790 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NUP153P49790 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NUP153P49790 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NUP153P49790 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NUP153P49790 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NUP153P49790 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NUP153P49790 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
NUP153P49790 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NUP153P49790 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NUP153P49790 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NUP153P49790 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NUP153P49790 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NUP153P49790 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
NUP153P49790 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
NUP153P49790 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NUP153P49790 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NUP153P49790 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
NUP153P49790 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NUP153P49790 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NUP153P49790 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
NUP153P49790 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NUP153P49790 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NUP153P49790 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NUP153P49790 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NUP153P49790 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NUP153P49790 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NUP153P49790 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NUP153P49790 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NUP153P49790 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NUP153P49790 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NUP153P49790 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NUP153P49790 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
NUP153P49790 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NUP153P49790 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NUP153P49790 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NUP153P49790 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NUP153P49790 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NUP153P49790 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NUP153P49790 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NUP153P49790 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NUP153P49790 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NUP153P49790 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NUP153P49790 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NUP153P49790 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NUP153P49790 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NUP153P49790 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NUP153P49790 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NUP153P49790 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NUP153P49790 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NUP153P49790 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NUP153P49790 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NUP153P49790 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NUP153P49790 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NUP153P49790 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NUP153P49790 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NUP153P49790 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NUP153P49790 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
NUP153P49790 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NUP153P49790 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NUP153P49790 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NUP153P49790 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NUP153P49790 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NUP153P49790 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NUP153P49790 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NUP153P49790 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NUP153P49790 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NUP153P49790 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NUP153P49790 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NUP153P49790 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NUP153P49790 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NUP153P49790 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NUP153P49790 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NUP153P49790 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NUP153P49790 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NUP153P49790 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NUP153P49790 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NUP153P49790 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NUP153P49790 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NUP153P49790 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NUP153P49790 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NUP153P49790 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
NUP153P49790 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NUP153P49790 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NUP153P49790 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NUP153P49790 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
NUP153P49790 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NUP153P49790 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NUP153P49790 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NUP153P49790 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NUP153P49790 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NUP153P49790 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms