Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms