Protein–RNA interactions for Protein: P43489

TNFRSF4, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF4P43489 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF4P43489 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF4P43489 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF4P43489 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF4P43489 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF4P43489 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF4P43489 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF4P43489 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF4P43489 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF4P43489 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF4P43489 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF4P43489 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF4P43489 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF4P43489 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF4P43489 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF4P43489 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF4P43489 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF4P43489 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF4P43489 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF4P43489 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF4P43489 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF4P43489 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF4P43489 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF4P43489 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFRSF4P43489 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFRSF4P43489 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF4P43489 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms