Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ETV4P43268 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ETV4P43268 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ETV4P43268 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ETV4P43268 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ETV4P43268 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ETV4P43268 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ETV4P43268 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ETV4P43268 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ETV4P43268 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ETV4P43268 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ETV4P43268 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ETV4P43268 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ETV4P43268 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ETV4P43268 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ETV4P43268 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ETV4P43268 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ETV4P43268 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ETV4P43268 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ETV4P43268 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ETV4P43268 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ETV4P43268 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ETV4P43268 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ETV4P43268 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ETV4P43268 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ETV4P43268 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ETV4P43268 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ETV4P43268 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ETV4P43268 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ETV4P43268 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ETV4P43268 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ETV4P43268 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ETV4P43268 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ETV4P43268 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ETV4P43268 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ETV4P43268 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ETV4P43268 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ETV4P43268 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ETV4P43268 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ETV4P43268 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ETV4P43268 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ETV4P43268 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ETV4P43268 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ETV4P43268 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ETV4P43268 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ETV4P43268 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ETV4P43268 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ETV4P43268 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ETV4P43268 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ETV4P43268 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ETV4P43268 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ETV4P43268 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ETV4P43268 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ETV4P43268 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ETV4P43268 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ETV4P43268 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ETV4P43268 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ETV4P43268 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ETV4P43268 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ETV4P43268 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ETV4P43268 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ETV4P43268 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ETV4P43268 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ETV4P43268 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ETV4P43268 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ETV4P43268 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ETV4P43268 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ETV4P43268 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ETV4P43268 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ETV4P43268 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ETV4P43268 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ETV4P43268 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ETV4P43268 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ETV4P43268 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ETV4P43268 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ETV4P43268 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ETV4P43268 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ETV4P43268 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ETV4P43268 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ETV4P43268 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ETV4P43268 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ETV4P43268 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ETV4P43268 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ETV4P43268 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ETV4P43268 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ETV4P43268 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ETV4P43268 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ETV4P43268 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ETV4P43268 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ETV4P43268 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ETV4P43268 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ETV4P43268 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ETV4P43268 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ETV4P43268 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ETV4P43268 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ETV4P43268 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ETV4P43268 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ETV4P43268 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ETV4P43268 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ETV4P43268 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms