Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARL4AP40617 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARL4AP40617 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms