Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPGP40121 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPGP40121 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPGP40121 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPGP40121 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPGP40121 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPGP40121 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPGP40121 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPGP40121 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPGP40121 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPGP40121 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPGP40121 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPGP40121 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPGP40121 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPGP40121 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPGP40121 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPGP40121 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPGP40121 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPGP40121 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPGP40121 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPGP40121 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPGP40121 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPGP40121 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPGP40121 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPGP40121 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPGP40121 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPGP40121 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPGP40121 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPGP40121 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPGP40121 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPGP40121 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPGP40121 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPGP40121 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPGP40121 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPGP40121 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPGP40121 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPGP40121 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPGP40121 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPGP40121 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPGP40121 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPGP40121 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPGP40121 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPGP40121 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPGP40121 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPGP40121 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPGP40121 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPGP40121 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPGP40121 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPGP40121 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPGP40121 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPGP40121 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAPGP40121 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAPGP40121 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAPGP40121 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAPGP40121 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAPGP40121 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPGP40121 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPGP40121 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPGP40121 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPGP40121 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPGP40121 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPGP40121 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPGP40121 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPGP40121 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPGP40121 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPGP40121 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPGP40121 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPGP40121 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPGP40121 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPGP40121 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPGP40121 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPGP40121 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPGP40121 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPGP40121 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPGP40121 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPGP40121 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPGP40121 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPGP40121 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPGP40121 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPGP40121 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPGP40121 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPGP40121 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPGP40121 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPGP40121 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPGP40121 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPGP40121 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPGP40121 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPGP40121 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPGP40121 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPGP40121 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPGP40121 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPGP40121 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPGP40121 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPGP40121 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPGP40121 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPGP40121 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPGP40121 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPGP40121 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPGP40121 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPGP40121 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms