Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms