Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDIT3P35638 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDIT3P35638 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDIT3P35638 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDIT3P35638 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
DDIT3P35638 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms