Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RYKP34925 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RYKP34925 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RYKP34925 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RYKP34925 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RYKP34925 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RYKP34925 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RYKP34925 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RYKP34925 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RYKP34925 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RYKP34925 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RYKP34925 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RYKP34925 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RYKP34925 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RYKP34925 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RYKP34925 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RYKP34925 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RYKP34925 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RYKP34925 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RYKP34925 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RYKP34925 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RYKP34925 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RYKP34925 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RYKP34925 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RYKP34925 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RYKP34925 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RYKP34925 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RYKP34925 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RYKP34925 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RYKP34925 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RYKP34925 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RYKP34925 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RYKP34925 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RYKP34925 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RYKP34925 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RYKP34925 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RYKP34925 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RYKP34925 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RYKP34925 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RYKP34925 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RYKP34925 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RYKP34925 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RYKP34925 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RYKP34925 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RYKP34925 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RYKP34925 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RYKP34925 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RYKP34925 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RYKP34925 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RYKP34925 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RYKP34925 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RYKP34925 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RYKP34925 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RYKP34925 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RYKP34925 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RYKP34925 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RYKP34925 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RYKP34925 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RYKP34925 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RYKP34925 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RYKP34925 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RYKP34925 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RYKP34925 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RYKP34925 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RYKP34925 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RYKP34925 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RYKP34925 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RYKP34925 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RYKP34925 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RYKP34925 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RYKP34925 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RYKP34925 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RYKP34925 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RYKP34925 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RYKP34925 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RYKP34925 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RYKP34925 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RYKP34925 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RYKP34925 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RYKP34925 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RYKP34925 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RYKP34925 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RYKP34925 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RYKP34925 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RYKP34925 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RYKP34925 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RYKP34925 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RYKP34925 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RYKP34925 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RYKP34925 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RYKP34925 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RYKP34925 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RYKP34925 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RYKP34925 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RYKP34925 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RYKP34925 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RYKP34925 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RYKP34925 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RYKP34925 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RYKP34925 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms