Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA11P31270 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms