Protein–RNA interactions for Protein: P31150

GDI1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI1P31150 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDI1P31150 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDI1P31150 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDI1P31150 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDI1P31150 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDI1P31150 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDI1P31150 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDI1P31150 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GDI1P31150 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDI1P31150 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDI1P31150 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GDI1P31150 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GDI1P31150 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GDI1P31150 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDI1P31150 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDI1P31150 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GDI1P31150 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDI1P31150 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GDI1P31150 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDI1P31150 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDI1P31150 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDI1P31150 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDI1P31150 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDI1P31150 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDI1P31150 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDI1P31150 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDI1P31150 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GDI1P31150 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDI1P31150 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDI1P31150 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDI1P31150 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDI1P31150 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDI1P31150 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDI1P31150 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDI1P31150 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDI1P31150 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GDI1P31150 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDI1P31150 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDI1P31150 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDI1P31150 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDI1P31150 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDI1P31150 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDI1P31150 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDI1P31150 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDI1P31150 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDI1P31150 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDI1P31150 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDI1P31150 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDI1P31150 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDI1P31150 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDI1P31150 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDI1P31150 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GDI1P31150 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDI1P31150 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GDI1P31150 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDI1P31150 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDI1P31150 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDI1P31150 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDI1P31150 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDI1P31150 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDI1P31150 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDI1P31150 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDI1P31150 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDI1P31150 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDI1P31150 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDI1P31150 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDI1P31150 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDI1P31150 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDI1P31150 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDI1P31150 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDI1P31150 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDI1P31150 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDI1P31150 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDI1P31150 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDI1P31150 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDI1P31150 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDI1P31150 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDI1P31150 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDI1P31150 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDI1P31150 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDI1P31150 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDI1P31150 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDI1P31150 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDI1P31150 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDI1P31150 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDI1P31150 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDI1P31150 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDI1P31150 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDI1P31150 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDI1P31150 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDI1P31150 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDI1P31150 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDI1P31150 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDI1P31150 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDI1P31150 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDI1P31150 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GDI1P31150 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDI1P31150 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDI1P31150 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GDI1P31150 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms