Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPINB3P29508 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms