Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB9P28065 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms