Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSMA3P25788 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms