Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRHP20396 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TRHP20396 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TRHP20396 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TRHP20396 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TRHP20396 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TRHP20396 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TRHP20396 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
TRHP20396 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TRHP20396 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TRHP20396 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TRHP20396 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TRHP20396 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TRHP20396 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TRHP20396 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TRHP20396 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TRHP20396 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRHP20396 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRHP20396 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRHP20396 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
TRHP20396 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRHP20396 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
TRHP20396 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRHP20396 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRHP20396 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRHP20396 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRHP20396 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRHP20396 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRHP20396 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRHP20396 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRHP20396 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRHP20396 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRHP20396 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRHP20396 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TRHP20396 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TRHP20396 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TRHP20396 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TRHP20396 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TRHP20396 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
TRHP20396 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TRHP20396 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
TRHP20396 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
TRHP20396 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
TRHP20396 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
TRHP20396 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TRHP20396 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TRHP20396 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRHP20396 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRHP20396 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRHP20396 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRHP20396 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRHP20396 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRHP20396 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRHP20396 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRHP20396 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRHP20396 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRHP20396 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRHP20396 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRHP20396 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRHP20396 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
TRHP20396 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TRHP20396 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TRHP20396 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
TRHP20396 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
TRHP20396 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TRHP20396 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TRHP20396 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TRHP20396 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TRHP20396 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TRHP20396 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TRHP20396 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TRHP20396 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TRHP20396 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TRHP20396 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC35.26■■■■□ 3.24
TRHP20396 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
TRHP20396 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TRHP20396 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TRHP20396 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TRHP20396 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TRHP20396 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TRHP20396 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TRHP20396 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
TRHP20396 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRHP20396 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRHP20396 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
TRHP20396 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRHP20396 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRHP20396 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRHP20396 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRHP20396 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRHP20396 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRHP20396 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRHP20396 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRHP20396 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRHP20396 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRHP20396 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRHP20396 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRHP20396 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRHP20396 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRHP20396 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms