Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NFKB1P19838 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms