Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPAN8P19075 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN8P19075 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms