Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LBPP18428 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LBPP18428 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LBPP18428 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LBPP18428 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LBPP18428 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LBPP18428 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LBPP18428 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LBPP18428 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LBPP18428 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LBPP18428 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LBPP18428 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LBPP18428 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LBPP18428 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LBPP18428 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LBPP18428 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LBPP18428 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LBPP18428 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LBPP18428 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LBPP18428 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LBPP18428 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LBPP18428 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LBPP18428 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LBPP18428 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LBPP18428 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LBPP18428 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LBPP18428 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LBPP18428 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LBPP18428 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LBPP18428 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LBPP18428 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LBPP18428 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LBPP18428 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LBPP18428 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LBPP18428 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LBPP18428 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LBPP18428 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LBPP18428 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LBPP18428 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LBPP18428 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LBPP18428 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LBPP18428 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LBPP18428 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LBPP18428 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LBPP18428 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LBPP18428 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LBPP18428 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LBPP18428 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LBPP18428 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LBPP18428 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LBPP18428 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LBPP18428 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LBPP18428 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LBPP18428 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LBPP18428 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LBPP18428 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LBPP18428 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LBPP18428 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LBPP18428 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LBPP18428 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LBPP18428 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LBPP18428 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LBPP18428 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LBPP18428 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LBPP18428 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LBPP18428 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LBPP18428 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LBPP18428 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LBPP18428 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LBPP18428 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LBPP18428 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LBPP18428 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LBPP18428 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LBPP18428 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LBPP18428 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LBPP18428 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LBPP18428 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LBPP18428 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LBPP18428 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LBPP18428 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LBPP18428 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LBPP18428 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LBPP18428 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LBPP18428 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LBPP18428 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LBPP18428 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LBPP18428 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LBPP18428 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LBPP18428 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LBPP18428 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LBPP18428 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LBPP18428 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LBPP18428 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LBPP18428 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LBPP18428 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LBPP18428 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LBPP18428 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LBPP18428 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LBPP18428 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LBPP18428 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms