Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB1P16220 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB1P16220 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB1P16220 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB1P16220 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB1P16220 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB1P16220 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB1P16220 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB1P16220 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB1P16220 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB1P16220 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB1P16220 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB1P16220 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB1P16220 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB1P16220 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB1P16220 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB1P16220 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CREB1P16220 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CREB1P16220 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CREB1P16220 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CREB1P16220 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB1P16220 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB1P16220 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB1P16220 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB1P16220 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB1P16220 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB1P16220 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB1P16220 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB1P16220 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB1P16220 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB1P16220 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB1P16220 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB1P16220 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB1P16220 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB1P16220 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB1P16220 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB1P16220 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB1P16220 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB1P16220 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB1P16220 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB1P16220 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB1P16220 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB1P16220 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB1P16220 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB1P16220 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB1P16220 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB1P16220 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB1P16220 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB1P16220 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB1P16220 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB1P16220 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB1P16220 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB1P16220 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB1P16220 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB1P16220 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB1P16220 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB1P16220 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB1P16220 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB1P16220 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB1P16220 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB1P16220 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB1P16220 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB1P16220 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB1P16220 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB1P16220 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB1P16220 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB1P16220 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB1P16220 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB1P16220 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB1P16220 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB1P16220 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB1P16220 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB1P16220 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB1P16220 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB1P16220 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB1P16220 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB1P16220 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB1P16220 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB1P16220 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB1P16220 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB1P16220 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB1P16220 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB1P16220 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB1P16220 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB1P16220 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB1P16220 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB1P16220 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB1P16220 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB1P16220 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB1P16220 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB1P16220 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB1P16220 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB1P16220 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB1P16220 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB1P16220 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB1P16220 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB1P16220 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB1P16220 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CREB1P16220 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CREB1P16220 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms