Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
MS4A1P11836 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MS4A1P11836 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms