Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HKR1P10072 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HKR1P10072 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HKR1P10072 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HKR1P10072 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HKR1P10072 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HKR1P10072 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HKR1P10072 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HKR1P10072 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HKR1P10072 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HKR1P10072 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HKR1P10072 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HKR1P10072 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HKR1P10072 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HKR1P10072 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HKR1P10072 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HKR1P10072 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HKR1P10072 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HKR1P10072 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HKR1P10072 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HKR1P10072 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HKR1P10072 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HKR1P10072 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HKR1P10072 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HKR1P10072 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HKR1P10072 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HKR1P10072 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HKR1P10072 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HKR1P10072 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HKR1P10072 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HKR1P10072 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HKR1P10072 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HKR1P10072 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HKR1P10072 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HKR1P10072 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HKR1P10072 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HKR1P10072 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HKR1P10072 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HKR1P10072 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HKR1P10072 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HKR1P10072 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HKR1P10072 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HKR1P10072 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HKR1P10072 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HKR1P10072 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HKR1P10072 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HKR1P10072 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HKR1P10072 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HKR1P10072 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HKR1P10072 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HKR1P10072 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HKR1P10072 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HKR1P10072 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HKR1P10072 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HKR1P10072 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HKR1P10072 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HKR1P10072 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HKR1P10072 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HKR1P10072 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HKR1P10072 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HKR1P10072 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HKR1P10072 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HKR1P10072 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HKR1P10072 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HKR1P10072 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HKR1P10072 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HKR1P10072 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HKR1P10072 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HKR1P10072 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HKR1P10072 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HKR1P10072 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HKR1P10072 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HKR1P10072 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HKR1P10072 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HKR1P10072 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HKR1P10072 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HKR1P10072 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HKR1P10072 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HKR1P10072 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HKR1P10072 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HKR1P10072 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HKR1P10072 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HKR1P10072 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HKR1P10072 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HKR1P10072 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HKR1P10072 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HKR1P10072 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HKR1P10072 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HKR1P10072 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HKR1P10072 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HKR1P10072 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HKR1P10072 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HKR1P10072 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HKR1P10072 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HKR1P10072 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HKR1P10072 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HKR1P10072 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HKR1P10072 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HKR1P10072 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HKR1P10072 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms