Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CGB3P0DN86 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms