Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC175P0C221 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms