Protein–RNA interactions for Protein: P09012

SNRPA, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPAP09012 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms