Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA5P08648 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms