Protein–RNA interactions for Protein: P05556

ITGB1, Integrin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1P05556 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB1P05556 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB1P05556 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms