Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms