Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SERPINC1P01008 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SERPINC1P01008 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SERPINC1P01008 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SERPINC1P01008 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SERPINC1P01008 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SERPINC1P01008 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SERPINC1P01008 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SERPINC1P01008 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SERPINC1P01008 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SERPINC1P01008 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SERPINC1P01008 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SERPINC1P01008 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SERPINC1P01008 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERPINC1P01008 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERPINC1P01008 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERPINC1P01008 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERPINC1P01008 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERPINC1P01008 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERPINC1P01008 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERPINC1P01008 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERPINC1P01008 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERPINC1P01008 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERPINC1P01008 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERPINC1P01008 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERPINC1P01008 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERPINC1P01008 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms