Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASS1P00966 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ASS1P00966 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASS1P00966 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASS1P00966 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASS1P00966 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASS1P00966 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASS1P00966 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASS1P00966 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASS1P00966 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ASS1P00966 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ASS1P00966 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASS1P00966 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASS1P00966 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ASS1P00966 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ASS1P00966 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASS1P00966 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASS1P00966 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASS1P00966 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASS1P00966 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASS1P00966 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASS1P00966 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASS1P00966 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASS1P00966 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASS1P00966 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASS1P00966 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASS1P00966 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASS1P00966 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASS1P00966 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASS1P00966 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASS1P00966 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASS1P00966 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASS1P00966 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASS1P00966 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASS1P00966 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASS1P00966 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASS1P00966 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASS1P00966 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ASS1P00966 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ASS1P00966 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASS1P00966 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASS1P00966 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASS1P00966 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASS1P00966 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASS1P00966 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASS1P00966 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASS1P00966 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASS1P00966 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASS1P00966 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ASS1P00966 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASS1P00966 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASS1P00966 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASS1P00966 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASS1P00966 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASS1P00966 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASS1P00966 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASS1P00966 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASS1P00966 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASS1P00966 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASS1P00966 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASS1P00966 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASS1P00966 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASS1P00966 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASS1P00966 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASS1P00966 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASS1P00966 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASS1P00966 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASS1P00966 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASS1P00966 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASS1P00966 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASS1P00966 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASS1P00966 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASS1P00966 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASS1P00966 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ASS1P00966 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ASS1P00966 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ASS1P00966 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ASS1P00966 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ASS1P00966 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ASS1P00966 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ASS1P00966 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ASS1P00966 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ASS1P00966 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASS1P00966 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASS1P00966 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASS1P00966 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASS1P00966 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ASS1P00966 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ASS1P00966 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ASS1P00966 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ASS1P00966 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ASS1P00966 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ASS1P00966 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASS1P00966 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASS1P00966 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASS1P00966 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASS1P00966 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASS1P00966 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASS1P00966 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ASS1P00966 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms