Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D2O95562 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D2O95562 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms