Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF12O95522 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRAMEF12O95522 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF12O95522 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms