Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LETM1O95202 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LETM1O95202 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LETM1O95202 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LETM1O95202 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LETM1O95202 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LETM1O95202 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LETM1O95202 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LETM1O95202 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LETM1O95202 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LETM1O95202 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LETM1O95202 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LETM1O95202 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LETM1O95202 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LETM1O95202 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LETM1O95202 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LETM1O95202 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LETM1O95202 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LETM1O95202 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LETM1O95202 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LETM1O95202 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LETM1O95202 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LETM1O95202 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LETM1O95202 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LETM1O95202 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LETM1O95202 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LETM1O95202 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LETM1O95202 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LETM1O95202 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LETM1O95202 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LETM1O95202 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LETM1O95202 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LETM1O95202 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LETM1O95202 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LETM1O95202 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LETM1O95202 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LETM1O95202 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LETM1O95202 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LETM1O95202 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LETM1O95202 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LETM1O95202 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LETM1O95202 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LETM1O95202 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LETM1O95202 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LETM1O95202 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LETM1O95202 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LETM1O95202 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LETM1O95202 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LETM1O95202 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LETM1O95202 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LETM1O95202 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LETM1O95202 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LETM1O95202 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LETM1O95202 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LETM1O95202 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LETM1O95202 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LETM1O95202 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LETM1O95202 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LETM1O95202 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LETM1O95202 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LETM1O95202 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LETM1O95202 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LETM1O95202 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LETM1O95202 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LETM1O95202 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LETM1O95202 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LETM1O95202 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LETM1O95202 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LETM1O95202 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LETM1O95202 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LETM1O95202 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LETM1O95202 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LETM1O95202 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LETM1O95202 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LETM1O95202 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LETM1O95202 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LETM1O95202 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LETM1O95202 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LETM1O95202 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LETM1O95202 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LETM1O95202 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LETM1O95202 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LETM1O95202 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LETM1O95202 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LETM1O95202 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LETM1O95202 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LETM1O95202 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LETM1O95202 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LETM1O95202 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LETM1O95202 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LETM1O95202 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LETM1O95202 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LETM1O95202 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LETM1O95202 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LETM1O95202 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LETM1O95202 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LETM1O95202 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LETM1O95202 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LETM1O95202 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LETM1O95202 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms