Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG12O94817 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG12O94817 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG12O94817 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG12O94817 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG12O94817 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG12O94817 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG12O94817 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG12O94817 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG12O94817 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG12O94817 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG12O94817 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG12O94817 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG12O94817 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG12O94817 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG12O94817 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG12O94817 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG12O94817 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG12O94817 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG12O94817 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG12O94817 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG12O94817 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG12O94817 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG12O94817 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG12O94817 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG12O94817 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG12O94817 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG12O94817 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG12O94817 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG12O94817 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG12O94817 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG12O94817 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG12O94817 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG12O94817 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG12O94817 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG12O94817 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG12O94817 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG12O94817 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG12O94817 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG12O94817 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG12O94817 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG12O94817 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG12O94817 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG12O94817 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG12O94817 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG12O94817 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG12O94817 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG12O94817 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG12O94817 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG12O94817 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG12O94817 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG12O94817 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG12O94817 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG12O94817 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG12O94817 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG12O94817 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG12O94817 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG12O94817 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG12O94817 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG12O94817 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG12O94817 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG12O94817 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG12O94817 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG12O94817 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG12O94817 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG12O94817 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG12O94817 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG12O94817 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG12O94817 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG12O94817 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG12O94817 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG12O94817 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG12O94817 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG12O94817 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG12O94817 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG12O94817 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG12O94817 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG12O94817 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG12O94817 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG12O94817 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG12O94817 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG12O94817 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG12O94817 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG12O94817 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG12O94817 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG12O94817 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG12O94817 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG12O94817 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG12O94817 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG12O94817 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG12O94817 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG12O94817 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG12O94817 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG12O94817 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG12O94817 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG12O94817 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG12O94817 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG12O94817 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG12O94817 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG12O94817 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms