Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKL5O76039 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKL5O76039 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDKL5O76039 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDKL5O76039 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDKL5O76039 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDKL5O76039 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDKL5O76039 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms